?Towards harmonization of DNA metabarcoding for monitoring marine macrobenthos: the effect of technical replicates and pooled DNA extractions on species detection

نویسندگان

چکیده

DNA-based monitoring methods are potentially faster and cheaper compared to traditional morphological benthic identification. DNA metabarcoding involves various methodological choices which can introduce bias leading a different outcome in biodiversity patterns. Therefore, it is important harmonize protocols allow comparison across studies this requires good understanding of the effect on diversity estimates. This study investigated impact PCR replicates detection macrobenthos species locations with high, medium low diversity. Our results show that two three were needed high detect at least 80% found six replicates, while four location In contrast general belief, larger body size or higher abundance sample did not increase its prevalence among replicates. However, rare less consistently detected all further pooling significantly alter patterns, although small number was lost. Finally, our confirm variation between especially for species. These contribute create reliable, time cost efficient characterization macrobenthos.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

an investigation of the impact of self monitoring on langauge teachers motivational practice and its effect on learners motivation

the central purpose of this study was to conduct a case study about the role of self monitoring in teacher’s use of motivational strategies. furthermore it focused on how these strategies affected students’ motivational behavior. although many studies have been done to investigate teachers’ motivational strategies use (cheng & d?rnyei, 2007; d?rnyei & csizer, 1998; green, 2001, guilloteaux & d?...

investigating the effect of motivation and attitude towards learning english, learning style preferences and gender on iranian efl learners proficiency

تحقیق حاضر به منظور بررسی تاثیر انگیزه و نگرش نسبت به یادگیری زبان انگلیسی، ترجیحات سبک یادگیری و جنسیت بر بسندگی فراگیران ایرانی زبان انگلیسی انجام شد. برای این منظور، 154 فراگیر ایرانی زبان انگلیسی در این تحقیق شرکت کردند. سه ابزار جمع آوری داده ها شامل آزمون تعیین سطح بسندگی زبان انگلیسی آکسفورد، پرسشنامه ترجیحات سبک یادگیری براچ و پرسشنامه انگیزه و نگرش نسبت به یادگیری زبان انگلیسی به م...

“the effect of risk aversion on the demand for life insurance: the case of iranian life insurance market”

abstract: about 60% of total premium of insurance industry is pertained?to life policies in the world; while the life insurance total premium in iran is less than 6% of total premium in insurance industry in 2008 (sigma, no 3/2009). among the reasons that discourage the life insurance industry is the problem of adverse selection. adverse selection theory describes a situation where the inf...

15 صفحه اول

the effect of task complexity on lexical complexity and grammatical accuracy of efl learners’ argumentative writing

بر اساس فرضیه شناخت رابینسون (2001 و 2003 و 2005) و مدل ظرفیت توجه محدود اسکهان (1998)، این تحقیق تاثیر پیچیدگی تکلیف را بر پیچیدگی واژگان و صحت گرامری نوشتار مباحثه ای 60 نفر از دانشجویان زبان انگلیسی بررسی کرد. میزان پیچیدگی تکلیف از طریق فاکتورهای پراکندگی-منابع تعیین شد. همه ی شرکت کنندگان به صورت نیمه تصادفی به یکی از سه گروه: (1) گروه موضوع، (2) گروه موضوع + اندیشه و (3) گروه موضوع + اندی...

15 صفحه اول

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Metabarcoding and Metagenomics

سال: 2021

ISSN: ['2534-9708']

DOI: https://doi.org/10.3897/mbmg.5.71107